慢性扁桃体炎不仅由于本身炎症蔓延可引起邻近器官的感染，如中耳炎、鼻窦炎，喉、气管、支气管炎等，更重要的是为人体常见的感染病灶之一，与急性肾炎、风湿性关节炎、风湿热、心脏病、长期低热等疾患关系密切。
因此，在扁桃体炎反复发作时除抗感染治疗外，必要时应手术治疗。
扁桃体过度肿大或发生肿瘤等疾病时亦应考虑手术治疗。